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中国科学院上海药物研究所PBCNet：药物先导化合物优化的人工智能新方法（图）
药物 先导化合物 人工智能
2023/12/1
先导化合物的结构优化（Lead optimization）是药物设计的核心环节，需要通过DMTA（设计-合成-测试-分析）的反复循环来提高化合物活性、特异性、成药性等性质。长期以来，先导化合物的活性优化高度依赖药物化学家的经验以及大量的人力和资源投入。基于结构的药物设计，尤其是高精度的结合自由能计算，可以通过部分模拟的DMTA循环来加速先导化合物活性优化过程。随着分子力场和构象采样算法的改进，自由...
中国科学院上海药物所提出基于序列的药物设计新方法（图）
上海药物所 药物设计 蛋白质结构 神经网络
2023/7/21
20世纪90年代以来，基于蛋白质结构的药物设计（SBDD）一直是创新药物发现的主流方法，在针对具有明确靶标的疾病治疗方面取得了进步。这种方法一般涉及多个步骤的复杂流程，包括建立蛋白质的三维（3D）结构，识别潜在的配体结合位点，并通过虚拟筛选或全新设计发现活性化合物等。SBDD流程中的每个步骤都有局限性，如许多蛋白质没有高分辨率的结构。虽然近年来的蛋白质结构预测技术如AlphaFold和RoseTT...
上海中医药大学杨凌团队创新构建生物标志物的自体追溯新方法（图）
生物标志物 上海中医药大学 羧酸酯酶
2023/7/3
近日，上海中医药大学杨凌团队创新性地发明了一种损伤性标志物的判定方法，该研究成果Accurate Assessment and Tracking the Process of Liver-Specific Injury by the Residual Tissue Activity of Carboxylesterase 1 and Dipeptidyl Peptidase 4近期正式在线发表于知...
2020年12月4日，国际学术期刊Molecular Therapy–Nucleic Acids在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）吴立刚研究组与上海市计划生育科学研究所李卫华研究组和扬州大学赵雅研究组合作的研究成果：“Identifying Cleaved and Noncleaved Targets of Small Interfering RNAs an...
北京大学化学与分子工程学院刘虎威/白玉课题组在疾病生物标志物的质谱超高灵敏检测和成像新方法方面取得重要进展（图）
北京大学化学与分子工程学院 刘虎威 白玉 疾病生物标志物 质谱超高灵敏检测 成像新方法
2019/1/4
北京大学化学与分子工程学院刘虎威/白玉副教授课题组设计合成了新型罗丹明类MS标签，并基于此发展了膜蛋白生物标志物的超高灵敏度、高通量、多目标及操作简便的常压敞开式质谱（AMS）免疫分析新方法。该方法可实现微升级体液中或几十个细胞表面的疾病蛋白标志物的原位检测，检测灵敏度达zeptomole（zmol）水平。相关成果以“Ultrasensitive Ambient Mass Spectrometry...
2018年10月9日，国际学术期刊《细胞通讯》（Cell Reports）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院（营养与健康研究院）计算生物学研究所韩敬东研究组的论文“Accurate Drug Reposition through Non-Tissue Specific Core Signatures from Cancer Transcriptomes”。该研究通过从多组织的癌症基因组学数据构...
中国科学院上海生命科学研究院发现系统研究蛋白质降解组的新方法（图）
蛋白质 流式细胞仪 DNA芯片技术 耐药
2014/10/29
2014年9月16日，国际学术期刊Cell Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所胡荣贵课题组的最新研究成果，文章中报道了一种基于双荧光的蛋白质组水平检测蛋白质稳定性变化的方法（Protein turnover assay, ProTA），以及利用该方法系统地研究了化疗药物蛋白酶体抑制剂硼替佐米(Bortezomib, BTZ)的药物作用及其肿瘤细胞产生...
2014年10月14日，由北京大学作为依托单位的国家重大科学研究计划项目“基于基因密码子扩展的蛋白质标记新方法”课题验收会在天然药物及仿生药物国家重点实验室举行，参加的四个课题组分别来自北京大学化学学院、中科院生物物理所和北京大学药学院。科技部基础司朱庆平处长全程出席会议，课题验收专家包括中国科学院上海生命科学研究院王恩多院士、南京大学华子春教授、军事医学科学院范明研究员、北京大学昌增益教授和张传...
分子光谱在生物药物和环境分析中新技术、新方法研究
分子光谱 药物代谢 环境监测
2008/7/8
本研究小组自行设计出一套成本低廉、操作简便、快速的流动注射分子发光实验装置。这一类新型装置的设计，不但优化了反应的发光产率，而且使载体远离检测器，减少了光散射背景，提高了灵敏度并有很好的实用性，该分析检测系统构思新颖、巧妙，“绿色”的操作程序，不仅简单、快速（每小时可进样100-120次）、成本低廉（消耗极少量的试剂），而且灵敏度高（可达到ng/ml-pg/ml）、检测限低，首次成功的将其应用于...