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近数十年来，随着高性能计算（HPC）的不断发展，摩尔定律依然有效，而计算机辅助药物设计方法也随之快速发展。HPC 在药物设计领域有多种关键应用，如药物-靶标结合强度预测（药效预测）、虚拟筛选、分子动力学模拟和蛋白质折叠等，这些应用明显加速了药物发现。