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2023年12月5日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所于涛课题组与美国加州大学伯克利分校Jay D. Keasling课题组,在《自然-催化》(Nature Catalysis)上发表了最新成果。二氧化碳合成的低碳化合物C1-3作为发酵原料,为微生物可持续生产食品及化学品提供了颇有潜能的方式。该研究利用合成生物学和代谢工程手段开发的酵母细胞平台,可将低碳化合物如甲醇、乙醇、...
2023年12月11日,中国科学院深圳先进技术研究院合成所罗小舟团队在Nature Communications发表题为UniKP: A unified framework for the prediction of enzyme kinetic parameters的文章。针对合成生物学和代谢工程领域湿实验测量酶动力学参数成本高、干实验算法难以准确预测等问题,研究团队提出了一种基于预训练大语言模...
2023年12月5日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所(以下简称“合成所”)于涛课题组与Jay D. Keasling课题组合作,在Nature  Catalysis发表了题为Metabolic engineering of yeast for the production of carbohydrate-derived foods and chemicals fr...
在合成生物学领域,人工碳同化途径和人工自养系统方兴未艾,并在应对环境危机和推动可持续物质生产中被寄予厚望。在这一进程中,无论是基于经验还是运用模型预测而取得的成绩,均为推动整个领域的发展贡献了力量。作为生化反应的基石,酶在途径实施中具有重要作用。同时,天然酶库为挖掘泛底物活性或新功能突变体提供了广泛的可能性。过去十年间,非氧化酵解凭借其低碳特征脱颖而出,在底盘开发和产品合成中持续展现出价值。因此,...
微藻在全球光合作用、二氧化碳固定及初级生产力中贡献卓著,是颇有前景的合成生物学底盘细胞。为了探索工业固碳产油微藻的表观遗传机制和生理作用,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心以海洋微拟球藻为模式,解析了野生型和6mA扰动突变株中N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,6mA)的分布规律和动态变化,并通过多组学数据整合分析,发现了6mA调控着微拟球藻在高光下的油脂积累。相关...
在合成生物学领域,人工碳同化途径和人工自养系统方兴未艾,并在应对环境危机和推动可持续物质生产中被寄予厚望。在这一进程中,无论是基于经验还是运用模型预测取得的成绩,都为推动整个领域的蓬勃发展贡献了重要力量。作为生化反应的基石,酶在途径实施中扮演着不可或缺的角色,天然酶库为挖掘泛底物活性或新功能突变体提供了广泛的可能性。过去的十年间,非氧化酵解凭借其低碳特征脱颖而出,在底盘开发和产品合成中持续展现出卓...
2023年11月22日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所罗小舟研究员团队在学术期刊Metabolic Engineering上发表了题为One-pot selective biosynthesis of Tyrian purple in Escherichia coli的文章。这项研究针对Tyrian purple在生产上面临化学合成毒性大、海螺提取得率低及生物合成选择性低等...
倍半萜吉玛烯A是吉玛烯家族化合物核心中间体,能够衍生出结构特异、功能多样的类倍半萜物质,以β-榄香烯最具代表性。这些化合物在抗癌、抑菌、抗病毒等领域表现出优异的生物学特性和巨大的商业价值。传统萜类物质生产依赖于化学合成或植物组织提取,存在产率低、资源浪费的缺点。2023年来,代谢工程和合成生物学的发展促进了微生物细胞工厂的高效构建,为化学品的微生物合成提供了新的选择。 
2023年11月15日,中国科学院大连化学物理研究所催化基础国家重点实验室理论催化创新特区研究组(05T8组)肖建平研究员团队和碳基资源电催化转化研究组(523组)汪国雄研究员团队在电催化一氧化氮还原反应(eNORR)合成氨研究方面取得新进展,在Cu6Sn5合金催化剂上实现了96.9%的氨法拉第效率和安培级电流密度。
很多人都听过“益母草”的名字。益母草(Leonurus japonicus Houtt.),是唇形科益母草属的传统药材,顾名思义,它在传统上常当作妇科用药,在亚洲和欧洲多地有着超过两千年的药用历史。益母草碱是益母草的主要药效成分,也是益母草属特有的天然产物。值得一提的是,有特殊气味的萜类化合物常常是唇形科药用植物的主要活性物质,而在益母草属中,活性物质却以益母草碱为代表的生物碱为主。2023年来的...
除虫菊(Pyrethrum cinerariifolium Trev.)是杀虫植物。它的干花中的杀虫成分——除虫菊酯,具有高效、安全、低毒、无残留等特点,成为绿色农业中的首选杀虫剂。中国科学院昆明植物研究所邱明华团队完成了除虫菊的推广种植,研发了二氧化碳超临界萃取技术(一代)、精制纯化技术(二代)为核心的两代现代天然除虫菊酯农药生产技术,帮助企业实现了规模化生产应用,形成了我国除虫菊酯...
2023年11月1日,中国科学院计算机网络信息中心人工智能部和物理研究所SF10组合作,通过使用来自400多万篇论文中提取的35675个无机材料固相反应合成过程,将数据处理为13878条高可信度的合成路径描述数据,并对开源大语言模型LLaMA2-7B进行微调训练,研发了专注于无机材料合成路径预测任务的大语言模型——MatChat(http://chat.aicnic.cn/onchat)。目前,该...
三尖杉生物碱因其多环复杂化学结构,特别是含叔碳和氮杂季碳两个相邻手性中心等合成挑战性,及重要抗癌生物活性,一直成为国际研究热点。目前该类生物碱全合成研究文献中,消旋体的合成研究占多数,而为数有限的不对称合成中仍多依赖于手性原料,故发展催化不对称的全合成新策略、新方法对解决来源受限的重要植物天然产物—三尖杉生物碱全合成具有重要意义。
传统微生物生产菌体蛋白存在低值原料的转化效率和速率低、蛋白质合成能力不足等问题。巴斯德毕赤酵母由于具有天然的甲醇同化能力被认为是生产甲醇单细胞蛋白(SCP)的理想宿主,但是其复杂的甲醇代谢途径和细胞内累积的甲醛生物毒性导致天然巴斯德毕赤酵母甲醇利用率低,不利于SCP的高效合成。此外,在实际生产中巴斯德毕赤酵母的发酵温度通常高于其最适生长温度(28-30 °C),对较高温度的不耐受会导致工业生产过程...
传统微生物生产菌体蛋白存在低值原料的转化效率和速率低、蛋白质合成能力不足等问题。巴斯德毕赤酵母由于具有天然的甲醇同化能力被认为是生产甲醇单细胞蛋白(SCP)的理想宿主,但是其复杂的甲醇代谢途径和细胞内累积的甲醛生物毒性导致天然巴斯德毕赤酵母甲醇利用率低,不利于SCP的高效合成。另外,在实际生产中巴斯德毕赤酵母的发酵温度通常要高于其最适生长温度(28-30 °C),对较高温度的不耐受会导致工业生产过...

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