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肽段酶切概率和质谱可检测性的深度学习预测（图）
肽段酶切 质谱 可检测性 深度学习
2023/6/13
在高通量蛋白质组学中，蛋白质首先会被酶切为肽段，再通过质谱仪进行检测分析，最后基于对质谱数据的解析完成对肽段和蛋白质的研究。然而，在质谱实验中，并不是所有理论上可能的肽段都能被检测到，造成了质谱数据的随机性和解读上的困难。准确的肽段酶切概率和可检测性预测能够对蛋白质组学的实验设计和数据分析提供有力帮助。
质谱是一种广泛应用于化学、生物医学、药学、环境、农业和能源等各领域的分子结构鉴定技术，这种技术通过准确测定分子离子和碎片离子的质量-电荷比来推导分子结构。如何将试样中待测组分有效气化、离子化，转变为具有不同质-荷比的气态离子是质谱仪器和分析方法研究的关键。基于不同物理化学原理的电离、解离方法各有特点，适合不同分析目的。常见的软电离技术一般产生稳定的偶电子离子，往往需要与其他技术联用才能实现分子离子...
探索并建立了一种快速、简便且高通量定量磷酸化蛋白质组的策略，即采用连续互补的磷酸化富集方法SMOAC（Sequentialenrichmentofmetaloxideaffinitychromatography）结合TMT（Tandemmasstag）标记技术定量磷酸化蛋白质组学。以3例经紫草素处理的及3例正常的人肝癌HepG2细胞为实验材料，经Trypsin酶解后的肽段用TMT10-plex试剂...