搜索结果: 61-75 共查到“知识库 化学 酶”相关记录441条 . 查询时间(0.242 秒)
脂肪组织中, 激素敏感脂肪酶(HSL)被认为是调节脂肪酸代谢的关键限速酶. HSL在糖尿病的发病过程中起重要作用. 抑制HSL活性有助于糖尿病的治疗, 因此探索新颖的HSL抑制剂变成当前研究的热门. 在激素敏感脂肪酶的作用机制和三维结构缺乏的情况下, 需要发展预测HSL抑制剂的方法. 本文采用几种机器学习方法(支持向量机((SVM)、k-最近相邻法(k-NN)和C4.5决策树(C4.5 DT))对...
应用遗传算法相似性程序(GASP), 以作用于I型人类免疫缺陷病毒(human immun-odeficiency virus type 1, HIV-1)整合酶(IN)的二酮酸类(diketoacids, DKAs)抑制剂构建药效团模型. 所选训练集分子均具有可靠的类药性特征及DKAs药效团特征. 尝试将抑制剂与药效团叠合后的构象和抑制剂与IN的对接构象进行叠合, 得到药效团模型与分子对接构象中...
乙酰胆碱酯酶抑制剂Corydaline的分子对接与开环衍生物的虚拟筛选
Corydaline 乙酰胆碱酯酶 分子对接 开环衍生物 虚拟筛选
2009/11/30
用分子对接软件GOLD, 研究了延胡索类生物碱corydaline与乙酰胆碱酯酶的结合模型, 并虚拟筛选了一系列具有不同碳链长度和取代基的开环衍生物以指导潜在高活性化合物的合成. 分子对接结果表明, corydaline与开口构象的酶结合可能性最大. 结合模型显示, corydaline的A环与外周阴离子位点Tyr334产生π-π堆积; 质子化氮原子与疏水位点Phe330产生阳离子-π作用; 而D...
分子动力学模拟方法研究结构水在糖原合成酶激酶-3β中的作用
糖原合成酶激酶-3β 结构水分子 分子动力学模拟
2009/11/27
用分子动力学模拟的方法揭示了结构水分子在糖原合成酶激酶-3β(GSK-3β)中的作用. 如果没有结构水, ATP嘌呤环的结合位置将发生偏移以填补结构水留下的空间; ATP结合口袋中的氢键网络将被破坏, 保守残基Lys85与ATP的磷酸根侧链只能形成一个保守氢键, 无法维持磷酸根转移所需的线性关系; 由于失去了氢键网络的稳定作用, Glu97和Lys85会向远离ATP的方向移动, 并导致Arg96的...
通过分子对接和三维定量构效关系(3D-QSAR)两种方法来确定两类马来酰胺类的糖原合成酶激酶-3β(GSK-3β)抑制剂的结合方式. 首先, 用分子对接确定抑制剂与GSK-3β结合模式及其相互作用; 然后用比较分子力场分析法(CoMFA)与比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)对48个化合物做三维定量构效关系的分析. 两种方法得出的交互验证回归系数分别为0.669(CoMFA)和0.683(Co...
胞液型磷脂酶A2能引发关节炎，针对胞液型磷脂酶A2的抑制剂有可能成为治疗关节炎的特效药，因此引起了广泛的关注.文章对于吡咯烷类胞液型磷脂酶A2抑制剂进行了三维定量构效关系研究，利用比较分子力场分析构建了该类分子的定量构效关系，得到三维等值线图，为胞液型磷脂酶A2抑制剂的进一步改造提供了有益的启示.
运用荧光光谱和紫外光谱, 结合分子模拟法研究了盐酸环丙沙星(CPFX)与胰蛋白酶(Trypsin)在不同温度条件下(288, 298和308 K)的相互作用. 研究发现CPFX对Trypsin有较强的荧光猝灭作用, 且为静态猝灭类型. 根据双对数方程处理荧光猝灭数据得到了CPFX与Trypsin在不同温度下的结合常数K和结合位点数n. 利用紫外光谱定性讨论了CPFX对Trypsin构象的影响. ...
采用分子力学和分子动力学方法, 考察了MMPs抑制剂、焦性没食子酸(Pyrogallic acid)和杨梅黄酮(Myricetin)与MMP-7的具体结合方式以及相互作用的情况. 研究结果表明, 在与MMP-7结合时, 杨梅黄酮比焦性没食子酸具有更高的亲合性, 因此杨梅黄酮对MMP-7有更好的效能, 这与实验测得的活性顺序相符. 另外, 密度泛函理论的计算结果表明, 此类抑制剂能够通过ZBG以单配...
金丝桃素分子结构及其与HIV病毒蛋白酶作用的分子动力学研究
金丝桃素 HIV蛋白酶 分子动力学模拟 分子对接
2009/11/25
采用用计算化学方法研究金丝桃素分子结构特征, 并用分子动力学方法研究其与HIV蛋白酶的相互作用, 探讨其可能的抗HIV病毒作用机理. 结果表明, 金丝桃素分子结构具有刚性特征, 与HIV蛋白酶在酶的催化活性位点与ASP-A25 and ASP-B25以氢键作用相结合.
新的α/β水解酶W14和W15的三维结构模建及分子对接研究
分子动力学 α/β水解酶 分子对接
2009/11/25
利用同源模建和分子动力学模拟方法, 模建了两个新发现的α/β水解酶超家族成员W14和W15的三维结构, 并通过与α-醋酸萘酯的对接研究, 从理论上提出Gly82和Val13为形成“氧洞”的关键残基,有利于稳定水解过程中的带负电的过渡态, 以及其它对复合物形成起到重要作用的氨基酸残基.
基于CdSe量子点与溶菌酶之间的相互作用, 采用共振光散射法建立了简单快速检测溶菌酶的新方法. 在优化的实验条件下, 当溶菌酶浓度在0.01~0.8 μmol/L范围内变化时, 散射光强度与溶菌酶浓度间呈现良好的线性关系, 相关系数为0.9960. 此方法对溶菌酶的检出限为5.2 nmol/L, 对0.09 μmol/L溶菌酶5次平行测定的相对标准偏差为2.1%, 此方法选择性较好, 常见离子、蛋...