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蛋白质组学出现之后,多维高效液相色谱(multidimensional HPLC,MD-HPLC)系统以其快速、高效、自动化程度高以及容易与质谱等其他技术联用等优势而成为蛋白质组学相关分析技术中研究应用的热点。本文主要以本实验室在蛋白质组学研究中的技术进展为主线,介绍了多维高效液相色谱技术的发展,包括经典的“bottom-up”技术和“top-down”式的多维高效液相色谱技术路线,以及为了提高系...
多维液相色谱分离技术及其在蛋白质组研究中的应用
多维液相色谱技术 蛋白质组学 综述
2009/11/18
对近年来多维液相色谱技术及其在蛋白质组学研究中的应用进行了系统综述。详细描述了由不同液相色谱模式构建的多维液相色谱系统,并介绍了其在蛋白质组表达谱、翻译后修饰、定量等方面的应用。此外,还对多维液相色谱的发展趋势和前景进行了展望。
蛋白质组学研究的核心技术之一是分离分析方法。该综述重点评述了分离分析技术在蛋白质组学研究,即在蛋白质组表达谱构建、翻译后修饰蛋白质组研究、蛋白质复合体和相互作用研究、蛋白质组定量研究中应用的新进展,介绍了各种分离分析方法的优点、应用范围和有待解决的问题。引用文献89篇。
基于M13噬菌体展示单链抗体文库的新型蛋白质均衡器的研制及其在肾病患者尿蛋白分析中的应用
蛋白质均衡器 M13噬菌体展示单链抗体文库 串联微柱反相液相色谱-电喷雾质谱 蛋白质 肾病患者 尿
2009/11/18
通过将展示单链抗体(scFv)文库的M13噬菌体固定于冷凝胶整体柱表面制备了一种新型蛋白质均衡器。由于展示的scFv片段具有种类多、数目大以及与蛋白质结合的特异性强等优点,因此其非常适合用于复杂蛋白质样品的预处理。将肾病患者尿蛋白在平衡器上反复上样5次后,依次使用2 mol/L NaCl、50 mmol/L Gly-HCl(pH 2.5)和凝血酶溶液洗脱与均衡器结合的蛋白质,收集各馏分,并采用串联...
用于相对和绝对定量的等量异位标签-二维液相色谱-串联质谱法分析雌二醇和血清剥夺对乳腺癌细胞内蛋白质含量的影响
用于相对和绝对定量的等量异位标签(iTRAQ) 二维液相色谱-串联质谱 雌激素 血清剥夺 乳腺癌细胞
2009/11/18
雌激素和血清中的激素及各种生长因子在乳腺癌的发生、发展过程中发挥着重要的作用。研究雌激素和血清对乳腺癌细胞中蛋白质组成和含量的影响对于阐明雌激素和血清对乳腺癌细胞影响的分子机理具有重要的意义。利用四重用于相对和绝对定量的等量异位标签(isobaric tags for relative and absolute quantification, iTRAQ)标记结合二维液相色谱-串联质谱(two-d...
整体柱是通过在柱管内原位聚合或固化的方法制备得到的具有多孔结构的整体棒状固定相,与传统的填充柱相比,具有通透性好、传质速率快、容易制备等优点,因此在分离分析领域特别是生物分离分析中发挥的作用日益增大。整体柱的制备及应用近年来也得到了快速发展,层出不穷的新型整体柱已被广泛用于色谱高效分离分析、固相萃取及酶反应器等方面,大大推动了分离分析科学的发展。本文主要总结了近五年来整体柱的制备技术及其在蛋白质组...
光学单分子方法探测蛋白质的功能
单分子探测 蛋白质 动力学
2009/11/17
过去20年中， 光学单分子探测的方法已经发展成为许多领域、特别是生物学领域研究的强有力工具. 单分子探测不仅能够给出物理量的平均值， 还可以给出有关分布的信息, 也能对一个分子的轨迹进行追踪. 这些独特的性质使单分子探测不仅仅在平衡体系， 如蛋白折叠、酶反应动力学、膜表面动力学等研究中发挥作用， 而且对非平衡体系的探测更具有其它方法无法比拟的优势, 同时单分子探测在生物活体中追踪分子时也有关键作用...
鼠肝癌淋巴道转移细胞模型的蛋白质组学研究
荧光差异双向凝胶电泳 高压液相色谱-电喷雾质谱联用 肝癌 淋巴结转移
2009/11/17
对2株来源于同一亲本细胞但淋巴道转移力显著不同的小鼠肝癌腹水型细胞株Hca-F(淋巴结转移率75%)和Hca-P(淋巴结转移率25%), 采用荧光差异双向凝胶电泳(2D DIGE)和DeCyder定量分析软件及HPLC-nESI-MS/MS技术, 定量分析和鉴定了小鼠肝癌细胞Hca-F和Hca-P的差异表达蛋白. 结果显示, 有116个蛋白质点表达水平存在明显差异(p<0.05), 在Hca-F...
以蓝斑背肛海兔(Notarcus leachii cirrosus Stimpson, NLCS)的口腔神经节(Buccal ganglion, BG)为研究对象, 按BG形态对称性, 解剖成亚BG(sub-BG, SBG), 并分为左SBG和右SBG, 简称为LSBG和RSBG. 用双向凝胶电泳(2D-PAGE)技术优化分离LSBG和RSBG全蛋白质, 并采用蛋白质组学和数据库比对技术筛选与鉴定...
通过可控沉积和交联制备蛋白质微胶囊
反溶剂 可控沉积 交联 蛋白质微胶囊
2009/11/16
通过加入反溶剂控制牛血清白蛋白(BSA)在碳酸锰微粒表面的沉积, 形成连续薄膜后交联, 去除模板后得到了尺寸均匀和分散良好的BSA中空微胶囊. 囊壁厚度可以通过滴加乙醇控制; 囊壁的截留分子量在70000—155000之间. 由于BSA含有丰富的自由羧基, 得到的微胶囊表现出pH响应性. 这种快速简便制备微胶囊的方法也可以应用于其它蛋白质及酶, 得到的生物相容的微胶囊将在药物控制释放等领域具有潜在...
复合分子印迹聚合物体系选择性富集蛋白质样品中的溶菌酶
复合分子印迹聚合物 溶菌酶 二氧化硅 聚丙烯酰胺凝胶
2009/11/13
考察了功能单体与模板蛋白的反应摩尔比、溶液pH值及离子强度对功能单体与模板蛋白之间相互作用的影响, 得出制备分子印迹聚合物的最佳条件. 在最佳条件下, 以溶菌酶(Lyz)为模板分子, 丙烯酰胺(AA)和N,N’-亚甲基双丙烯酰胺(BisAA)为聚合基质, 二氧化硅为固体制孔剂, 制备了复合分子印迹聚丙烯酰胺凝胶, 并用平衡吸附实验研究了其吸附性能和识别选择性. 研究结果表明, 该聚合物对模板蛋...
蛋白质溶胶-凝胶包埋法分子印迹复合膜的制备及渗透机理研究
分子印迹聚合物复合膜 膜渗透机理 蛋白质分子印迹 膜分离
2009/11/13
分别以牛血红蛋白、牛血清白蛋白和溶菌酶3种蛋白质为模板分子, 采用表面涂布的方法制备了在Nylon微孔滤膜表面覆盖有聚丙烯酰胺凝胶层的分子印迹复合膜, 并用扫描电镜对制备的分子印迹膜的表面形态和孔结构进行了表征, 发现支撑膜的表面及内部微孔表面均被一层丙烯酰胺凝胶所覆盖. 对用不同蛋白为模板制备的分子印迹膜进行了这3种蛋白的单一组分和双组分混合溶液渗透实验. 结果表明, 各蛋白底物在印迹膜上的渗...
蛋白质结构建模的后期优化策略
同源建模 分级开放式优化 显性溶剂 分子动力学
2009/11/13
以Lip8为研究对象, 以分级开放式优化和组合优化为优化策略, 分别采取四种不同的优化手段对相同的初始模型进行了优化, 同时比较了含水体系与不含水体系的优化过程, 最终获得8个相应优化后的蛋白模型. 采用Procheck, Errat, Profile 3D及Ramachandran 图等方法对上述8个模型进行评估. 通过比较各项评估结果, 研究了不同优化方法对最终模型准确性的影响, 结果表明,...
维拉帕米作用下急性心梗大鼠比较蛋白质组学研究
维拉帕米 蛋白质组 双向电泳
2009/11/13
以急性心梗大鼠为研究对象, 应用双向凝胶电泳法(2-DE)分析比较了维拉帕米作用下急性心梗大鼠心肌蛋白表达的差异, 从蛋白质水平探讨了维拉帕米心肌保护作用的发生机制. 结果表明, 与假手术组及模型组相比, 维拉帕米给药组心肌组织中有8个蛋白点表达显著上调, 7个蛋白点表达显著下调. 采用质谱(MALDI-TOF-MS)分析结合数据库检索, 共鉴定了其中的15种蛋白质, 可按功能分为如下4类: (1...