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2024年1月16日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部天然产物及糖工程研究组（1805组）尹恒研究员团队在裂解多糖单加氧酶研究领域取得新进展。裂解多糖单加氧酶（Lytic polysaccharide monooxygenase，LPMO）是近年来碳水化合物活性酶（CAZymes）中新发现的一类金属酶，它们通过独特的氧化机制，可以高效切割常规水解酶难以降解的顽固多糖的糖苷键，在木质纤维素...
中国科学院青岛能源所提出理性设计P450过加氧酶的隧道工程新策略（图）
隧道工程 细胞色素 单加氧酶 催化活性
2023/9/2
细胞色素P450单加氧酶是自然界中最重要的氧化酶之一，广泛参与生物体内重要内外源物质的合成与代谢，不但在医学和药学等生命健康领域得到广泛研究，而且其对极具挑战性的惰性碳-氢键选择氧化反应的优异催化能力，也激起合成化学与合成生物学等相关领域科学家的极大兴趣。然而自然界中以氧气（O2）作为末端氧化剂的绝大多数P450单加氧酶要通过一个复杂的氧化还原系统来实现其催化功能。利用还原态的过氧化氢（H2O2）...
2022年6月6日，南京农业大学生命科学学院蒋建东教授应邀在《Annual Review of Microbiology》期刊在线发表了题为《Oxygenases as Powerful Weapons in the Microbial Degradation of Pesticides》的综述论文。文章对微生物中加氧酶的催化机制、在农药降解中的作用等进行了系统总结，并对加氧酶的多样性、电子传递链...
中国科学院福建物质结构研究所结构化学国家重点实验室李春森课题组在国家自然科学基金重点项目和中科院战略性先导科技专项等的资助下，采用组合QM/MM计算方法以及MD模拟方法，深入研究了野生型含镍槲皮素2,4-双加氧酶（Ni-QueD）及其Glu76Asp和Glu76Gln两种突变体催化氧化降解槲皮素的反应全过程，发现并阐明了Ni-QueD通过活性中心Ni原子配位的Glu76残基采取质子耦合电子传输过程...
中国科学院化学研究所在预测双铁加氧酶含氧活性中间体结构方面获进展（图）
中国科学院化学研究所 双铁加氧酶 含氧活性 中间体结构
2017/10/26
中国科学院化学研究所光化学院重点实验室研究员陈辉在理论计算预测双铁加氧酶含氧活性中间体结构研究方面取得系列进展。在前期工作中，针对蓝藻醛去甲酰化加氧酶(cADO)，科研人员对其含氧活性中间体结构、57Fe穆斯堡尔谱参数、底物氧化机理等，开展了多尺度QM/MM（混合量子力学/分子力学）理论计算模拟研究，证实了其中间体结构是O2与醛底物形成的过氧半缩醛结构(图1)，而不是以往通常认为的过氧化物结构。研...
在中国科学院化学研究所理论计算化学平台项目和国家自然科学基金委的支持下，化学所光化学院重点实验室研究员陈辉，在理论计算预测双铁加氧酶含氧活性中间体结构研究方面取得系列进展。在前期工作中，针对蓝藻醛去甲酰化加氧酶(cADO)，科研人员对其含氧活性中间体结构、57Fe穆斯堡尔谱参数、底物氧化机理等，开展了多尺度QM/MM（混合量子力学/分子力学）理论计算模拟研究，证实了其中间体结构是O2与醛底物形成的...
喹啉加氧酶中氧气扩散的通道分析
喹啉加氧酶 氧气扩散 随机加速分子动力学 伞状抽样
2019/1/21
通过生物信息学分析、量化计算优化、CAVER和MDpocket预测、随机加速分子动力学及伞状抽样动力学模拟等方法，对喹啉加氧酶（HOD）中的氧气扩散途径进行了计算预测.结果表明，氧气在HOD中的反应位点包埋在蛋白内部，而HOD中有数条可能的通道供氧气进出，其中长度最短的通道具有最高的优先度，不仅在随机加速动力学模拟中具有最高的氧气逸出概率，而且伞状抽样方法计算得到的自由能也最低.此通道的内端位于底...
甲烷单加氧酶的化学模拟: 酚氧双羧酸根桥联Fe~2(III)和 Mn~2(III)配合物合 成、表征及催化性能
甲烷单加氧酶 铁络合物 锰络合物 催化性能 苯P 烯烃 环氧化反应
2007/12/22
摘要 合成表征了酚氧、双羧基桥联双组氨酸的手性双铁核配合物和双锰核配合物,研究了它们催化亚碘酰苯对烯烃的环氧化反应和对环烷烃的羟化反应。结果表明这种Fe~2(III)和Mn~2(III)配合物均是有效的甲烷单加氧酶(MMO)模型化合物,其中Fe~2配合物能较好地再现MMO的某些性质,如电子光谱等。Fe~2配合物催化苯乙烯环氧化反应生成环氧苯乙烷的产率为840%(以催化剂计),且R-(+)-构型对映...
氧化和加氧酶的化学模拟 I. MPc、MTPP/DMF(M=Fe、Co、Cu、Pe和TPP分别为酞菁和四苯基卟啉环；DMF为N-N '二甲基甲酰胺)体系的电子光谱和吸氧动力学
MP(M=Fe,Co,Cu P=Pc,TPP) 大环配合物 电子光谱化学 模拟
2010/2/21
通过电子光谱法测定MPc的Q_(0-0)带和MTPP的Soret带吸光度随时间的变化, 研究了MP在DMF介质中的吸氧动力学, 按竞争串行反应机理的处理, 表明MP的催化活性有如下关系:
MPc>MTPP; Fe>Co>Cu
MTPP在空气中的吸氧速率小于在纯氧中的, 其比值约相当于空气中的氧分压; 研究了含硫配体巯基乙醇和含氧配体抗坏血酸对上述体系的影响, 前者使MP谱带发生较大的变化,...