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中国科学院上海药物研究所PBCNet：药物先导化合物优化的人工智能新方法（图）
药物 先导化合物 人工智能
2023/12/1
先导化合物的结构优化（Lead optimization）是药物设计的核心环节，需要通过DMTA（设计-合成-测试-分析）的反复循环来提高化合物活性、特异性、成药性等性质。长期以来，先导化合物的活性优化高度依赖药物化学家的经验以及大量的人力和资源投入。基于结构的药物设计，尤其是高精度的结合自由能计算，可以通过部分模拟的DMTA循环来加速先导化合物活性优化过程。随着分子力场和构象采样算法的改进，自由...
G-蛋白偶联受体（G protein-coupled receptor，GPCR）是细胞表面受体家族中最大的一类，调控着人体各种生命活动且与疾病密切相关，有超过30%的药物作用于GPCR。而B类GPCRs是一类重要的多肽激素受体，包括胰高血糖素受体（GCGR）、胰高血糖素样肽-1受体（GLP-1R）、葡萄糖依赖性胰岛素释放多肽受体（GIPR）和甲状旁腺激素受体1（PTH1R）等在内的共15个激素受...
中国科学院上海药物研究所王春河研究员（图）
王春河研究员 中国科学院 上海药物研究所
2023/7/14
王春河研究员,研究方向1. 单克隆及双特异性抗体药物分子的发现、筛选和工程技术改造2. 新型抗体化学药物偶联体（ADC）药物的连接子改造。
胰高血糖素样肽-1（GLP-1）受体是当前治疗II型糖尿病和肥胖症最受关注的药物靶标之一。GLP-1受体激动剂不仅能促进胰岛素分泌、抑制胰高血糖素分泌和降低血糖，还能延迟胃排空、抑制食欲，从而减轻体重。GLP-1受体激动剂司美格鲁肽能够降低糖化血红蛋白水平接近1.8%、降低体重超过15%，被认为是革命性的治疗肥胖症产品。2022年，司美格鲁肽的全球销售额为108亿美元，2023年预期销售额将超过2...
由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的COVID-19全球大流行已持续三年，给人们的日常生活带来了巨大而深远的影响，且目前奥密克戎亚系分支仍在不断产生变异，持续威胁着人们的生命健康。因此，针对SARS-CoV-2的疫苗和抗病毒药物的研发仍具有重要的研究价值。
急性髓系白血病（AML）是死亡率最高的血液类肿瘤之一，其中FLT3基因突变占比近30%。虽已有3款FLT3抑制剂（FLT3i）上市药物用于治疗FLT3突变型AML，但仍有30%-50%病人表现出对FLT3i药物的原发耐药。因此，探究FLT3i原发耐药机制及相关对策具有迫切的临床需求和转化价值。
中国科学院上海药物研究所赵玉军研究员（图）
赵玉军研究员 小分子抑制剂 上海药物研究所
2023/2/22
赵玉军, 中国科学院上海药物研究所研究员,课题组长。2003年本科毕业于江苏省苏州大学化学化工学院，2019年研究生毕业于新加坡南洋理工大学获有机化学博士学位，2009-2015 年在美国密西根大学癌症中心从事博士后研究。主要从事的激酶和蛋白质相互作用小分子抑制剂的设计合成及生物活性研究。
基于小分子荧光染料的荧光定量技术被广泛应用于药物发现、细胞分析、体外诊断、环境检测和生物医学成像等领域。相对于可见光染料，近红外染料由于更低的荧光背景，应用更为广泛。但目前常见的商业近红外染料具有结构复杂、分子量大、斯托克位移小等缺点。大斯托克斯位移染料由于吸收与发射曲线交叉较少，荧光成像性噪比高，受到越来越多的重视。但结构简单、分子量小、斯托克斯位移大的近红外染料报道较少。
中国科学院上海药物研究所举行代谢性疾病研究中心揭牌仪式（图）
肝癌 代谢性疾病 中国科学院
2023/7/11
2021年11月22日，上海药物所在承嘏厅举行了代谢性疾病研究中心揭牌仪式，上海药物所陈凯先院士，所长、中心主任李佳等出席揭牌仪式，仪式由副所长赵强主持。
组胺是人体内的一种重要的化学传导物质，它在变态反应和宿主对病原微生物的防御反应中发挥着重要的功能。细菌感染，包括铜绿假单胞菌的感染，可诱导宿主免疫细胞产生或释放组胺。在人体的肠道菌群和呼吸道菌群中，许多细菌含有组氨酸脱羧酶，其可催化组氨酸脱羧生成组胺。此外，许多食物，比如刀鱼、金枪鱼、牛奶、鸡蛋、黄豆、羊肉、辣椒等食物中的组胺含量非常丰富。由此，在自然环境下或感染人体的过程中，病原细菌可能会经常面...
中国科学院上海药物研究所揭示细菌感应铜新的信号转导通路（图）
细菌 铜 信号 转导通路
2021/3/16
铜几乎是所有生物体的必须微量元素，但铜过量会产生毒性。铜天然具有抗菌功效，且作为消毒剂用于防止伤口感染已有几个世纪的历史。近年来，利用铜制品预防院内感染也颇受关注。同样令人感兴趣的是，宿主的免疫系统可利用铜离子的抗菌作用来抵御细菌入侵。中国科学院上海药物研究所蓝乐夫研究团队以重要人类病原菌－铜绿假单胞菌为研究模型，发现新的感应铜离子的信号转导通路。相关工作以“A novel copper-sens...
中国科学院上海药物研究所揭示细菌感应铜新的信号转导通路（图）
中国科学院上海药物研究所 细菌感应 铜新 信号转导通路
2021/3/24
铜几乎是所有生物体的必须微量元素，但铜过量会产生毒性。铜天然具有抗菌功效，且作为消毒剂用于防止伤口感染已有几个世纪的历史。近年来，利用铜制品预防院内感染也颇受关注。同样令人感兴趣的是，宿主的免疫系统可利用铜离子的抗菌作用来抵御细菌入侵。中国科学院上海药物研究所蓝乐夫研究团队以重要人类病原菌－铜绿假单胞菌为研究模型，发现新的感应铜离子的信号转导通路。相关工作以“A novel copper-sens...
多巴胺（dopamine，DA）是人体一种重要的单胺类神经递质，参与对中枢神经系统（CNS）以及外周神经系统（PNS）多种生理功能的调控。在CNS中，DA介导神经细胞之间的信号传递，在大脑奖励机制、动机产生、欣快感发生以及行为调节等生理过程中发挥作用，而在PNS中，DA则主要是作为一种旁分泌信使，参与对血压、消化系统以及免疫功能等的调控。DA通过人体内的多巴胺受体（dopamine recepto...
近日，中国科学院上海药物研究所黄河课题组与芝加哥大学赵英明教授团队合作，通过全面分析哺乳动物细胞中的Kbhb底物，系统揭示了新型蛋白动态修饰β-羟基丁酰化（Kbhb）的关键调控因子。该研究成果于北京时间2月25日在线发表于Science Advance杂志。细胞代谢为生命过程提供能量，同时代谢物可通过与蛋白质发生共价结合来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知，但其介导细胞信号...