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2023年4月3日,精密测量院李从刚研究团队,以高灵敏的19F化学标记方法,结合电穿孔递送技术,实现了人源细胞内6-40 kD的结构蛋白观测,其检测浓度低至1.0 μM,接近了部分蛋白质的生理浓度。相关研究成果发表于《德国应用化学》(Angew. Chem. Int. Ed.)。
大连化学物理研究所利用自主搭建的质谱仪器研究蛋白质结构(图)
质谱仪器 蛋白质结构 氨基酸侧链
2023/4/14
近日,大连化学物理研究所生物分子结构表征新方法研究组(1822组)王方军研究员、刘哲益副研究员团队与西南交通大学封顺教授团队合作,利用自主搭建的高能紫外激光解离—串联质谱仪器,揭示了质子化氨基酸侧链的正电荷在电喷雾离子化过程中影响蛋白质结构的分子机制,为质谱精确表征蛋白质高级结构提供了参考。
一种用于蛋白质结构聚类的聚类中心选择算法
蛋白质结构 聚类 属性阈值 近邻传播
2011/7/29
提出一种对蛋白质结构聚类中心进行选择的算法. 聚类是蛋白质结构预测过程中必不可少的一个后处理步骤, 而目前在蛋白质结构预测中常用的属性阈值(Quality threshold, QT)聚类算法依赖于由经验得出的聚类半径; 其他聚类算法, 如近邻传播(Affinity propagation, AP)聚类算法也存在影响聚类分布的参数. 为克服对主观经验参数的依赖,本文提出一种聚类中心选择算法(Exe...
行波离子迁移质谱技术在蛋白质结构研究中的应用
离子迁移 行波离子迁移谱 蛋白折叠 蛋白四级结构
2010/9/16
离子迁移(ionmobility)是一种在分子离子化后,非溶液环境下的分离技术。与依靠离子质量与电荷比进行分离的质谱技术不同,离子迁移是根据离子形状与电荷比实现分离的。因此,离子迁移技术可以实现对质量相同而形状不同的离子分离,其与质谱技术联用可为研究者提供更加丰富的结构信息。最新发展的行波离子迁移技术大大提高了灵敏度和分离速度,适用于研究天然浓度条件下的蛋白质,其在蛋白质单体折叠与去折叠以及蛋白复...
基于氨基酸的疏水特性, 将离散小波变换与延时交叉相关分析相结合, 提出了一种分析蛋白质结构、功能和进化关系的新方法——序列小波层次相关法. 以丝氨酸蛋白酶超家族中Trypsin种属为研究对象, 描述了该方法在揭示不同物种的Trypsin蛋白质进化关系中的应用; 以蛋白质酪氨酸磷酸酶、血红蛋白和溶菌酶为例, 采用该方法揭示了蛋白质之间功能与序列的内在关系. 该方法为非参数方法, 具有简单...