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让DNA“跳舞”：新测序法灵敏度提高百倍（图）
DNA 医学生物技术
2023/10/19
在进行常规的DNA检测时，样本中通常含有许多目标DNA以外的分子，这可能会干扰结果。据美国《科学时报》5日消息，美国马萨诸塞大学阿默斯特分校的研究人员开发出一种技术，无需额外成本即可将DNA检测灵敏度提高100倍。相关论文发表在《美国国家科学院院刊》上。
Sam50 是分拣和组装机器 (SAM) 复合物的关键组成部分，也参与桥接线粒体外膜和内膜接触。然而，Sam50 的生理和病理功能仍然很大程度上未知。
2021年2月16日，中国科学院上海药物研究所李佳研究员和臧奕研究员共同在国际知名期刊Cell Reports杂志上在线发表了题为“AMPK-Mediated Phosphorylation on 53BP1 Promotes c-NHEJ”的研究成果。该项研究首次深入阐明了AMPK促进DNA双链损伤修复的作用方式以及具体机制，发现了AMPK通过对新底物53BP1的磷酸化修饰促进c-NHEJ修复，...
中国科学院上海药物研究所徐华强课题组与合作团队首次解析de novo DNA甲基转移酶和天然底物核小体的高分辨率结构（图）
中国科学院上海药物研究所 徐华强 de novo DNA甲基转移酶 天然底物 核小体 高分辨率
2020/10/19
中科院上海药物研究所徐华强课题组与美国温安洛研究所Peter Jones课题组、Karsten Melcher课题组于北京时间2020年9月23日在国际顶级期刊《NATURE》在线发表了题为“Structure of nucleosome-bound DNA methyltransferases DNMT3A and DNMT3B”的重要研究成果。研究团队利用Cryo-EM技术首次解析了de no...
近日，美国耶鲁大学医学院的研究人员发现一种抗癌药物能够阻止某些癌细胞修复DNA。这种称为西地尼布（cediranib）的药物与其他试剂联合使用可能有潜力对通过特定途径产生DNA修复的癌细胞造成致命打击。相关研究结果发表在Science Translational Medicine上，论文标题为“Cediranib suppresses homology-directed DNA repair th...
CUDC-907诱导胶质瘤细胞DNA损伤与自噬的实验研究
CUDC-907 胶质瘤 DNA损伤 PI3K/Akt信号通路 自噬
2020/9/10
探讨新型组蛋白去乙酰化酶（histone deacetylase，HDAC）/磷脂酰肌醇3-激酶（phosphatidyl-inositol 3-kinase，PI3K）双靶点抑制剂CUDC-907对人胶质瘤U251细胞DNA损伤、细胞周期及自噬的影响。方法：采用不同浓度的CUDC-907处理U251细胞24 h，MTT法检测细胞活力的变化；激光共聚焦显微镜观察DNA损伤标志物γ-H2AX在细胞内...
有效的设计和合成DEL化合物库最大的难度在于DEL分子中的DNA部分限制了可用的有机化学反应类型，严重制约了DEL平台进一步拓展化合物库化学空间的多样性。开发能兼容DNA的化学工具是构建多样性化合物库的关键。中国科学院上海药物研究所陆晓杰课题组联合上海安进公司（Amgen）成功开发了第一例可用于构建DEL的C-H官能团化反应（DOI: 10.1021/acs.orglett.8b01837）。在钌...
核酸编码化合物库（DNA Encoded Library, DEL）作为小分子药物筛选的重要工具，已经被各大制药公司广泛运用到筛选药物靶点的苗头化合物（Hit）中。目前，GSK通过DEL技术平台开发出的sEH抑制剂GSK2256294和RIP1激酶抑制剂GSK2982772已进入二期临床研究，验证了这一技术的有效和实用性。相较于传统的组合化学，DEL平台具有合成更加高效，化合物库的化学空间更大，筛...
Penn Dental team tweaks DNA to improve plant-based medicines
Penn Dental team tweaks DNA plant-based medicines
2016/11/4
Henry Daniell, a professor in the departments of Biochemistry and Pathology in the School of Dental Medicine, has found great success in using genetic engineering to coax lettuce and tobacco plants to...
2015年3月10日，国际学术期刊EMBO MOLECULAR MEDICINE 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所姜海研究组等合作研究的最新成果：A DNA/HDAC dual-targeting drug with significantly enhanced anticancer potency。该成果成功研发了一个DNA/HDAC双靶点的新型药物，并通过对该药...
内源性或者环境中的甲基化分子会在多个部位修饰胞内DNA，由此引致诱变性病变甚至致死。为了避免甲基化引起的不良后果，生物体内存在多种DNA甲基化损伤修复机制以保持基因组的完整性，这其中包括了DNA糖基化酶、DNA甲基转移酶以及AlkB介导的氧化脱甲基酶这三类主要的酶类。大肠杆菌AlkB蛋白是依赖于Fe2+和α-酮戊二酸的一种氧化脱甲基酶，它可以氧化目标甲基基团并释放出甲醛以避免DNA甲基化损伤。
近日，湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室、化学化工学院和生物学院谭蔚泓教授课题组研发出了DNA纳米火车。该物质可用于向肿瘤细胞靶向输送抗癌药物。这一研究成果已经在美国科学院院刊上发表。
鹿茸线粒体DNA的指纹鉴定研究
鹿茸 特异性引物 随机扩增多态DNA 聚合酶链反应
2013/7/29
通过鹿茸特异性引物鉴别和随机扩增多态DNA(RAPD)鉴别的比较，选择一种更简便的方法用于鉴别鹿茸。 方法 采用盐析法从梅花鹿茸、马鹿茸、驯鹿茸、市售鹿茸等样品中抽提线粒体DNA，并应用试剂盒进行纯化。进行特异性引物扩增和序列测定，同时进行随机扩增多态DNA扩增。结果 梅花鹿茸，马鹿茸，驯鹿茸以及部分市售鹿茸经特异性引物扩增后均可在琼脂糖凝胶中显示313 bp片段，只是条带亮度不同。而其余市售鹿茸...
探讨硒对氟诱导的原代大鼠肝细胞氧化应激和DNA损伤的拮抗作用。方法 采用改良原位2步非循环灌流法及多次过滤低速离心法分离原代大鼠肝细胞,实验设空白对照组、氟染毒组(氟化钠250、500、1 000、2 000 μmol/L,染毒24 h)和硒干预组(亚硒酸钠10或100 nmol/L,干预4 h);测定细胞内活性氧(ROS)、丙二醛(MDA)、谷胱甘肽(GSH)含量及超氧化物歧化酶(SOD)活力,...